Aaltopahvin poikkileikkauskone on yksi tärkeimmistä aaltopahvin tuotantolinjan yksittäisistä koneista. Poikkileikkauskone on jaettu mekaaniseen poikkileikkauskoneeseen ja tietokoneohjattuun poikkileikkauskoneeseen erilaisten voimansiirron ohjausmenetelmien vuoksi. Tietokoneistettua poikkileikkauskonetta ohjaa teollinen ohjaustietokone. Asetetun pituuden mukaan leikkurin akselia ohjataan pyörimään ja leikkaamaan pahvia. Yhdessä mekaanisen osan tarkan voimansiirron kanssa leikkausvirhettä voidaan säätää alueella ±1 mm. Tietokoneohjattu poikkileikkauskone sisältää spiraaliveitsen poikkileikkauskoneen ja suoraveitseisen poikkileikkauskoneen. Kierreveitsen poikkileikkauskone sopii paremmin paksun pahvin nopeaan leikkaamiseen, ja paperin leikkaus on vakaa ja terän käyttöikä on pitkä.